В последние же недели войны, когда преимущество в Косово перешло от сербов к албанским повстанцам, Пентагон отклонил просьбу Кларка завершить воздушные атаки вблизи той стороны границы, где преобладает албанское население. Хотя американские силы не высаживались на территории Косова, Пентагон остерегался перейти ту скользкую грань, за которой могло начаться наступление на войска альянса, сообщает CNN.
С развитием косовского конфликта администрация Клинтона, которого Кларк называет талантливым политиком, ради сохранения мира на Балканах решила откровенно поговорить с югославским президентом Милошевичем. Однако, даже не дождавшись результатов этой беседы, НАТО начало воздушные атаки. Стремясь установить мир, США фактически развязали войну, в которой погибло немало мирного населения и значительно пострадал имидж альянса в мире. Некоторые важные проблемы, связанные с бомбардировкой Косова, отмечает Кларк, и до сих пор остаются нерешенными. «Мы должны учиться на Косовской операции, — заявил он в интервью CNN. — Ничего не изменилось. Если и дальше хоть что-то не изменится, проблема будет углубляться.»